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(1) 연구소장
연구소장은 연구소를 대표하고 제반 사업을 총괄하며 연구소의 모든 업무에 대해 최종 책임을 진다.
(2) 자문위원회
자문위원은 본 연구소의 전직 소장 약간 명으로 구성되며 운영 전반에 대해 조언을 한다.
(3) 연구윤리위원회
연구윤리위원회는 본 연구소의 연구와 관련된 각종 학술활동을 기획, 지원하는 임무를 담당한다. 이와 함께 연구윤리위원회는 연구윤리 및 연구진실성 확보를 위해 노력한다. 본 위원회는 연구인력의 연구부정행위를 방지하고, 진실성을 확보하기 위해 구체적인 가이드라인을 제시한다.
(4) 인사위원회
인사위원회는 연구소 인력 운영의 채용과 평가, 승진 등과 관련된 인력 운영의 제반 사항을 담당한다. 특히 인문한국 사업과 관련된 인력의 공개채용 일정과 범위를 결정하고 선발하는 역할을 담당한다.
(5) 출판편집위원회
편집위원회는 연구소에서 출간되는 정기간행물과 단행본을 기획하고 출판하는 업무를 수행한다. 본 위원회는 연구소 학술지인 『아프리카연구』를 연 2회 출판(원고 모집, 심사, 편집, 출판)하고 연구총서를 기획, 출판한다. HK사업기간에는 HK사업위원회와 공동으로 교양서와 학술총서, 번역서 등을 단계 별로 기획, 출판한다.
(6) 연구소운영위원회
운영위원회 산하에는 HK사업위원회와 연구소사업위원회를 둔다. 운영위원회의 기능은 연구소의 학술활동 및 제반 사업, 연구소 운영의 관리감독, 규정의 개폐에 관한 사항 및 연구소의 예산 및 결산 심의를 한다.
(7) HK사업위원회
HK사업위원회는 연구소장과 사업위원 5명 이내, HK교수 및 연구교수 약간 명으로 구성된 독립적 조직이다. HK사업위원회는 사업관리 전반을 책임지며, 산하에 HK학술평가심의회 및 4개의 팀을 둔다.
① HK연구기획팀: 기획활동을 담당한다.
② HK아카이브팀: 종합정보시스템 구축에 필요한 자료의 분류 및 Web mastering을 담 당한다.
③ HK교육지원팀: 교육의 중점 내용은 본 사업을 추진하는 데 필요한 현지어 교육과 현 지조사 방법론 등에 관한 것이다.
④ HK대외협력팀: 본 사업을 추진하는 데 필요한 국내외 네트워크를 구축한다. 또한 국 내외 주요 연구소와의 MOU 및 활동계획을 HK연구기획팀과 공동으로 진행한다.
HK사업위원회는 본 연구소와는 별도로 인사와 예산, 사업의 기획과 진행에 있어 독립성을 확보한다.
(8) 연구소사업위원회
연구소사업위원회는 연구소의 학술활동을 기획하고 수행하는 한편, 각종 출판과 문화사업을 추진한다. 특히 해외 주요 아프리카연구소들과 네트워크를 구축해 공동학술활동을 추진할 계획이다. 이 외에도 국내의 유관기관과 함께 공동으로 문화사업을 기획하고 추진한다.
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